Баобаб цвіте протягом декількох місяців, весь час, поки йдуть дощі. Але кожна квітка живе лише одну ніч! Увечері свіжий, пружний бутон розкриває ніжні, шовковисті пелюстки, а з першими променями сонця вони втрачають блиск і в'януть.

З жовтня до грудня баобаб зацвітає. Квітки у баобаба великі (до 20 см у поперечнику), білі з п'ятьма пелюстками та пурпуровими тичинками, на висячих квітконіжках.

Період цвітіння баобаба припадає на жовтень-грудень, коли рослина скидає листя. На позбавлених зелені гілках з'являються бутони. Досягши в діаметрі 20 см, вони повисають на довгих квітконіжках.